1、胃肠功能差不宜吃 每百克奇亚籽富含34克左右的膳食纤维，而且这些膳食纤维还以不水溶性膳食纤维为主，吃后不容易消化，对于胃肠功能差的人来说不能吃，因为因为胃肠功能差者多食膳食纤维会对胃肠道造成刺激，引起腹胀、腹痛等现象，而患有痉挛性便秘、小肠堵塞者应停止摄取高膳食纤维食物，否则会加重病情。
2、缺铁和缺钙的人 由于奇亚籽富含较高的膳食纤维，而摄取过多的膳食纤维会影响钙、铁的吸收，如本身缺铁和缺钙的人食用膳食纤维高的食物，反而不利于补充钙和铁，容易加重缺铁和缺钙的症状。
3、有过敏反应的人群 奇亚籽是芡欧鼠尾草的种子，这些植物种子中可能含有一些成分会导致过敏，如有对芝麻、薄荷或者芥菜籽有过敏症状的人群，就不建议吃奇亚籽的，因为都是属于同一个植物属系，吃后以免引起过敏反应，过敏症状可表现为：腹痛、腹泻、身上其红疹、瘙痒等。
4、服用抗凝血剂的人群 由于奇亚籽中含有丰富的Omega-3，而Omega-3具有抗凝血功效，因此若有服用抗凝血剂则要注意，避免一起使用，理论上可能增加出血的风险，还有开刀前几天应停止食用，最好是在医生的指导下是否能够食用奇亚籽。
5、低血压患者 奇亚籽可以有效降低舒张压水平，适宜高血压患者食用，但对于低血压患者来说应远离奇亚籽，以免加重病情。
