冬瓜如果已经切开了，要用保鲜膜贴上放在阴凉通风处，最好不要放在冰箱，容易发生冷害；如果是没切开的冬瓜，贮藏的适宜条件是通风良好，温度最好保持在10-15℃，相对湿度为70-75%为佳，一般可保存数月。
冬瓜之类的瓜果类蔬菜，有的个头很大，短时间是吃不完的，但是因为这些蔬菜本身有瓜壳的保护，所以储存的时间还是挺久的，但是在冬瓜切开以后，一般切面上就会渗出黏液，这时可以用一块比切面大一点的保鲜膜贴上，用手按压贴紧，一般可以保持3-5天不烂，如果切面处腐烂了，将腐烂的部分削去，剩下的还可以继续食用。
其实冬瓜的贮藏方法有很多，其中窖藏是比较简便易行和贮藏时间较长的一种。
冬瓜喜温耐热，属冷敏性蔬菜，要有合适的贮藏条件，可保存数月，要注意冬瓜不耐低温贮藏，低于10℃会发生冷害。还有，冬瓜的含水量较高，嫩瓜和过分成熟的瓜不宜贮藏，贮藏的冬瓜一般要求九成熟，皮和肉比较厚，而且质地较密、品质较好，表面青皮发亮和布满蜡质。
在贮藏时，要防止日光曝晒，采收前1周要严防雨淋，可以选择天气凉爽时，早晨用剪刀来剪摘，严防擦伤、碰伤和冬瓜内部损伤。
