秋刀鱼虽然是一种营养价值特别高的水产食材，但是这种鱼的鱼肉中含有微量毒素，如果人们过量食用，这些毒素就会在人体内部堆积，会危害人体内脏器官的健康，时间长了就会让多种疾病高发，对人类身体健康不利。
秋刀鱼除了含有微量毒素以外，它并没有其它副作用存在，大多数人群都可以适量食用，另外要注意的是，肝硬化的病人也是不适合吃秋刀鱼的。因为秋刀鱼中有廿碳五烯酸，廿碳五烯酸的代谢产物之一是前列环素，该物质能够抑制血小板聚集，而肝硬化病人因为凝血因子生成障碍，血小板数量本来就较低，若进食含廿碳五烯酸多的鱼后，血小板凝聚作用再次被减低，就很容易引起出血，且难以止住。
