我们都知道芝士蛋糕是用弹簧扣平锅制作的，制作中最好把弹簧扣平锅放到四周有边缘的烤盘上进行烤焙，因为尽管我们尽力确保它已经扣紧，弹簧扣平锅还是会有漏出的可能。这样做可以防止弹簧扣平锅由于在烘焙过程中漏出内料而弄脏烤箱，也可以防止弹簧扣突然松开而把蛋糕弄坏。如果厨房中没有有边缘的烤盘的话，可以在弹簧扣平锅的底部用铝纸包好一层也可以起到防漏的效果。
要判断芝士蛋糕是否已经烤好，我们可以观察它的顶部表面。对于大多数烤好了的芝士蛋糕来说，蛋糕的边缘会稍微膨胀并变成淡金色（变成金棕色就表示蛋糕烤过头了）。顶部应该是无光泽，而用手轻弹边缘的话，接触部分会动但不会有液体的抖动，蛋糕的中央位置会比边缘柔软。只是蛋糕在烤焙过程中会轻微发酵，但在冷却后会定型并固化。如果蛋糕上出现裂纹不用担心，因为裂纹会在冷却的时候变小并消失。我们可以在芝士蛋糕出炉的时候用黄油刀在蛋糕四周刮一圈，然后随着冷却它就会稍微缩小，而且也不会粘住弹簧扣平锅了。
芝士蛋糕的冷却可以是取出后冷却或直接关闭烤箱电源而让蛋糕放在烤箱中、打开烤箱门冷却。在蛋糕冷却到室温后再放入冰柜冷藏3-4小时，或者是冷藏过夜，这样出来的芝士蛋糕就拥有标准的漂亮外形了。
